К финальным соревнованиям розыгрыша 50-го Кубка страны допускаются команды, занявшие 1 и 2 места на I этапе в своих группах.
28 октября в полуфинальных матчах встречаются «Волга» Ульяновск - СКА-«Нефтяник» Хабаровск и «Енисей» Красноярск - «Динамо» Москва. Место проведения матчей II этапа будет определено на конкурсной основе в соответствии с поданными заявками. День приезда команд - 27 октября. Победители полуфиналов 30 октября проводят финальный матч.
Если в матчах второго этапа победитель не определён в основное время игры, то назначаются два дополнительных тайма по 10 минут, до первого забитого гола. Если победитель матча не выявлен и в дополнительное время, то он определяется с помощью пробития послематчевой серии 12-ти метровых ударов, в соответствии с Положением о послематчевых пенальти.